Райер и остальные члены экипажа «Гнезда наблюдателей» покидают Землю через искривление пространства, известное как «Проект Исход». Мисаки Курэха не оказывается среди них — она остаётся на планете в момент финальной схватки с Гулем и видит, как Земля меняется, оказываясь запечатанной временным барьером.

Экипаж пытается найти выход из пространственно-временного лабиринта, но реальность вокруг них нестабильна. Оси времени смещаются, порождая бесчисленные варианты «сейчас», и перед Райером возникают разные версии Мисаки — из тренировочной школы, из детства. Она, что должна была исчезнуть после инцидента с проектом Exodus, всё ещё существует в этих фрагментах.

Мисаки пробуждается во второй раз, и её ответы на вопросы о собственном прошлом меняют ход событий. Смогут ли герои отыскать настоящий хэппи-энд среди раздробленных временных линий — остаётся открытым.