Фубуки просыпается на борту неизвестного соединения. Корабли-девушки возвращаются в строй после боя, но вокруг — не привычная база, а чужая акватория, где не работают карты и радиосвязь. Вместе с Юдати и Муцуки она пытается понять, куда их занесло, пока в тумане не проявляются силуэты знакомых, но уже потопленных противников.

Флот натыкается на следы прошлых сражений, которые не сходятся с официальными записями. Обнаруживается, что девочки-корабли могут видеть обрывки чужих воспоминаний — фрагменты гибели тех, кто не вернулся. Это ставит под вопрос саму природу их существования и цели командования, которое отдаёт приказы, не объясняя причин.

Фильм продолжает линию сериала, но уводит героинь в сторону от турнирных боёв. Здесь меньше экшена, больше тихих сцен, где персонажи смотрят на воду и молчат. Конфликт строится не на силе оружия, а на том, что значит помнить тех, кого больше нет, и можно ли доверять тем, кто ведёт тебя в бой.

Фубуки приходится выбирать между приказом и собственной памятью, между долгом и тем, что она успела узнать о погибших. Решение даётся не через громкую битву, а через короткий разговор, после которого мир вокруг неё перестаёт быть прежним.